Sous la houlette du Sénat, la Cour des comptes pointe les moyens considérables consacrés aux ENR. Elle préconise que cette question soit clairement posée à l'heure de la révision de la PPE. Le Parlement veut s'inviter dans les discussions.
Un référé de la Cour des comptes relatif à l'Anah critique l'absence de contrat d'objectifs depuis trois ans, des programmes dont l'efficacité est insuffisamment évaluée et des finances menacées par les fluctuations du prix des quotas de CO2.
Un rapport de la Cour des comptes revient sur les difficultés rencontrées par l'EPR. Avant d'envisager la construction d'autres réacteurs, l'État doit mettre en place un soutien financier adapté et élaborer une trajectoire énergétique à long terme.
L'atteinte de l'objectif de 10% d'énergie renouvelable dans les transports implique un changement de la politique de soutien aux agrocarburants, a estimé dans son rapport public annuel 2016 la Cour des comptes.